В девятом сезоне Роман Шилов возвращается в строй и переводится в Главное Управление МВД по Северу-Западу. Теперь зона его ответственности – весь регион. Отдел Шилова будет заниматься раскрытием резонансных преступлений. С «гражданки» вернётся Джексон, а из патрульно-постовой службы — Паша Арнаутов.
Первое дело отдела Шилова не заставило себя долго ждать – в торговом центре одного из городов Карелии происходит взрыв. Есть жертвы. Шилов подключается к расследованию и выясняет, что причиной трагедии стала борьба двух влиятельных лиц Лесноозерска за должность мэра и контроль над прибыльным предприятием города. Борьба идет не на жизнь, а на смерть.
Шилова пытаются пустить по ложному следу, надавить на его руководство, угрожают его семье, но Шилов и его друзья идут до конца. Они задерживают преступника, но это всего лишь исполнитель. Шилов понимает, что прошел только «первый уровень» на подступах к преступной организации, с которой ему еще предстоит столкнуться… В ходе следующего расследования Шилов вновь пересекается со своей случайной знакомой Марианной, о которой он вспоминал все это время. Марианне очень нужна его помощь. Похоже, что в личной жизни Шилова грядут большие перемены.